Онкогенетика: выявление онкогенов в материале опухолей
Определение мутаций гена PDGFRa
Тест используется для определения наличия мутаций в гене PDGFRAдля решения вопроса о проведении таргетной терапии.
Ген PDGFRA кодирует рецептор тромбоцитарного фактора роста альфа (PDGFRa), который является членом семейства тирозинкиназных рецепторов III типа. Данное семейство также включает рецептор KIT. PDGFRA и KIT расположены в одном и том же локусе, 4q12, их белковые структуры очень схожи и состоят из нескольких доменов, каждый из которых играет специфическую роль в процессе активации тирозинкиназного домена. Несколько изоформ тромбоцитарного фактора роста (PDGF) могут связываться с рецептором и активировать его. Активированный PDGFRA запускает сходные нисходящие пути, что и активированный KIT, такие как JAK-STAT3, PI3K-AKT-mTOR и RAS-MAPK. Данные каскады важны для регуляции ключевых клеточных функций, таких как пролиферация и апоптоз.
Мутации в гене PDGFRA приводят к конститутивной, лиганд-независимой активации рецептора и, как следствие, нижележащих путей, что приводит к увеличению пролиферативной активности и ингибированию апоптоза. Активирующие точечные мутации в гене PDGFRA были описаны у небольшой группы пациентов с гастроинтестинальными стромальными опухолями (ГИСО): в 5–10% случаев. Опухоли, не несущие мутации в гене c-Kit, чаще имеют мутации PDGFRA. Было показано, что мутации в гене PDGFRA были обнаружены в 35% случаев KIT-отрицательных опухолей.
Тирозинкиназные ингибиторы (ТКИ) обладают противоопухолевой эффективностью у с-Kit-отрицательных пациентов, у которых присутствуют мутации в гене PDGFRA (RUSSCO2019). Однако не все активирующие мутации в PDGFRA являются биологически эквивалентными. Некоторые мутации PDGFRA, в частности мутация D842V, характеризуются нечувствительностью к ТКИ, однако большинство мутаций чувствительны к данному препарату. Таким образом, определение мутационного статуса гена PDGFRA рекомендовано для принятия решения о проведении таргетной терапии у пациентов с нерезектабельной опухолью, рецидивами и метастатическим ГИСО.
Показания к назначению исследования:
Рекомендовано пациентам с гастроинтестинальными стромальными опухолями для определения возможности применения таргетной терапии иматинибом.
Подготовка к исследованию: специальной подготовки не требуется.
Материал для исследования: фиксированные формалином и залитые парафином блоки тканей со стеклами.
Метод исследования: полимеразная цепная реакция
Сроки исполнения: 5 рабочих дней
Форма представления результата: качественный.
Референсные значения: патогенных мутаций в 14, 18 экзонах гена PDGFRAне обнаружено.
Интерпретация результата:
Отсутствие мутаций в гене PDGFRAне свидетельствует об отсутствии эффективности применения таргетной терапии ТКИ у пациентов с гастроинтестинальными стромальными опухолями (при нерезектабельных опухолях, рецидиве или метастатической заболевании).
Наличие активирующей мутации D842Vв гене PDGFRAсвидетельствует об отсутствии эффективности применения ТКИ у пациентов с гастроинтестинальными стромальными опухолями (при нерезектабельных опухолях, рецидиве или метастатической заболевании).
Наличие активирующей мутации в 14 или 18 экзоне (исключение D842V) гена PDGFRAсвидетельствует об эффективности применения ТКИ у пациентов с гастроинтестинальными стромальными опухолями (при нерезектабельных опухолях, рецидиве или метастатической заболевании).
Основная литература:
1. Никулин М.П., Архири П.П., Владимирова Л.Ю., Жабина А.С., Мещеряков А.А., Носов Д.А. и соавт. Практические рекомендации по лекарственному лечению гастроинтестинальных стромальных опухолей. Злокачественные опухоли : Практические рекомендации RUSSCO#3s2, 2019 (том 9). С. 477–485.
2. Mei L, Smith SC, Faber AC, et al. Gastrointestinal Stromal Tumors: The GIST of Precision Medicine. Trends Cancer 2018;4(1):74-91.
3. Evans EK, Gardino AK, Kim JL, Hodous BL, Shutes A, Davis A, et al. A precision therapy against cancers driven by KIT/PDGFRA mutations. Sci Transl Med 2017;9:eaao1690. doi:10.1126/scitranslmed.aao1690.
4. ESMO/European Sarcoma Network Working Group. Gastrointestinal stromal tumours: ESMO Clinical Practice Guidelines for diagnosis, treatment and follow-up. Ann Oncol 2014;25 Suppl 3:iii21-6.
5. Mehren M Von, Randall RL, Benjamin RS, Boles S, Bui MM, Ganjoo KN, et al. Soft tissue sarcoma, version 2.2018: Clinical practice guidelines in oncology. JNCCN J Natl Compr Cancer Netw 2018. doi:10.6004/jnccn.2018.0025.