Цена анализа
9 500 ₽
Срок выполнения:
до 8 рабочих дней
Код ПМУ:
01.02.15.1530
Добавить анализ

Секвенирование гена SMN1 при наличии 1 копии

Цена анализа
9 500 ₽
Срок выполнения теста:
до 8 рабочих дней
Код ПМУ:
01.02.15.1530
Добавить анализ
Показания:
  • Гетерозиготная делеция гена SMN1, выявленная при проведении количественного анализа;
  • Подозрение на спинальную мышечную атрофию на основе анамнеза и клинической симптоматики: гипотония, миодистрофия, снижение сухожильных рефлексов.
Биоматериал:
Венозная кровь в вакуумной пробирке с ЭДТА, фиолетовая крышка, от 2 мл
Подготовка к исследованию:
Специальной подготовки не требуется. Исследование проводится натощак (не принимать пищу 3 часа до исследования, можно пить воду).
Исследуемые показатели:
Точечные мутации единственной копии SMN1
Метод измерения:
Секвенирование
Единицы измерения:
Качественное исследование

Проксимальная спинальная мышечная атрофия представляет собой аутосомно-рецессивное нервно-мышечное заболевание, вызванное мутациями в гене SMN1, который расположен на длинном плече 5 хромосомы, и характеризующееся прогрессирующими симптомами периферического паралича и мышечной атрофии вследствие дегенерации нижних моторных нейронов.

К развитию 5q-СМА приводят мутации в гене SMN1 (survival motor neuron), который кодирует одноименный белок выживаемости мотонейронов - SMN. Наиболее частой причиной данного заболевания является делеция 7-8 экзонов SMN1 в гомозиготном состоянии, при которой отсутствуют обе копии гена, а также конверсия гена SMN1 в его неактивную копию SMN2, которая происходит вследствие высокой идентичности данных генов. Однако 5-10% случаев приходятся на гетерозиготные компаундные мутации, при которых имеет место делеция гена SMN1 на одной аллели и патогенные мутации на другой. У пациентов с делецией в компаунд-гетерозиготном состоянии описаны как точечные мутации на второй аллели, создающие новые донорные сайты сплайсинга и приводящие к образованию стоп-кодона, так и дупликации, приводящие к сдвигу рамки считывания, а также делеции, инсерции и миссенс-мутации. Самой редкой причиной 5q-СМА являются две точечные компаундные гетерозиготные мутации.

Известно, что точечные мутации могут быть обнаружены в любом из девяти экзонов гена SMN1. Однако наиболее подверженными мутациям являются 3 и 6 экзоны. Кроме того, мутации в данных экзонах, как правило, ассоциированы с наиболее тяжелыми типами 5 q-СМА. Экзон 3 кодирует Tudor-домен белка, который вместе с SMN участвует в сборке сплайсосомальных малых ядерных рибонуклеопротеидов, участвующих в сплайсинге пре-мРНК. Вероятно, это доказывает его важную роль в функционировании белка выживаемости мотонейронов и объясняет тяжесть течения заболевания при мутациях в 3 экзоне.

В результате точечных мутаций единственной копии SMN1 у компаунд-гетерозигот происходит деградация транскриптов данного гена, что приводит к дефициту белка SMN. В норме белок выживаемости моторных нейронов также принимает участие в аксональном транспорте белков в альфа-мотонейронах спинного мозга, что может объяснить избирательную чувствительность нижних двигательных нейронов к его дефициту. Дефицит SMN приводит к дегенерации альфа-мотонейронов спинного мозга и ствола, что обусловливает характерные проявления 5q-СМА: проксимальную, как правило, симметричную мышечную слабость и атрофию, бульбарные нарушения, гипотонию, снижение сухожильных рефлексов, фасцикуляции.

Интерпретация

Секвенирование гена SMN1 проводится с целью выявления точечных мутаций при наличии у пациента клинической симптоматики, характерной для 5q-СМА, и выявленной при проведении количественного анализа гетерозиготной делеции гена SMN1.

В таком случае оставшийся ген SMN1 следует секвенировать с целью выявления компаунд-гетерозиготного состояния.

  • Обнаружение патогенной мутации во второй копии гена SMN1 при наличии делеции в гетерозиготном состоянии подтверждает диагноз 5q-СМА.

  • Если секвенирование указывает на наличие интактного гена SMN1 при фенотипе, характерном для CMA, включая результаты ЭМГ, должны быть рассмотрены другие нозологии с поражением мотонейронов.

 

Теги:
Спинальная мышечная атрофия, проксимальная спинальная мышечная атрофия 5q, болезнь Верднига-Гоффмана, болезнь Дубовица, болезнь Кугельберга-Веландер, 5q-СМА, СМА, SMA, athrophy, миопатия,
Цена анализа
9 500 ₽
Использованная литература:

1) Диль А.В., Назаров В.Д., Сидоренко Д.В., Лапин С.В., Эмануэль В.Л. Исследование особенностей генетических изменений гена SMN1 при спинальной мышечной атрофии 5q. Нервно-мышечные болезни. 2022;12(3):36-44. https://doi.org/10.17650/2222-8721-2022-12-3-36-44

2) Wirth B., Karakaya M., Kye M.J. et al. Twenty-five years of spinal muscular atrophy research: from phenotype to genotype to therapy, and what comes next. Ann Rev Genom Hum Genet 2020;21(1). https://doi.org/10.1146/annurev-genom-102319-103602

3) Butchbach M.E.R. Genomic variability in the survival motor neuron genes (SMN1 and SMN2): Implications for spinal muscular atrophy phenotype and therapeutics development. Int J Mol Sci 2021;22(15):7896-917. https://doi.org/10.3390/ijms22157896

Похожие материалы

Меню